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   至(zhi)今(jin)，四極質譜儀(yi)與其它(ta)質譜儀(yi)相比較(jiao)，仍然是應用得(de)廣(guang)泛(fan)LC/ APIMS儀(yi)(yi)器。單級(ji)四(si)極(ji)質(zhi)(zhi)(zhi)譜(pu)(pu)儀(yi)(yi)的(de)(de)主要優點是(shi)相對(dui)可靠、優良的(de)(de)性(xing)能(neng)價(jia)格比(bi)。適合(he)于定(ding)(ding)性(xing)、定(ding)(ding)量分析。四(si)極(ji)質(zhi)(zhi)(zhi)譜(pu)(pu)儀(yi)(yi)主要缺點是(shi)得(de)到的(de)(de)是(shi)低分辨(bian)質(zhi)(zhi)(zhi)譜(pu)(pu)，只有在(zai)測定(ding)(ding)的(de)(de)成分是(shi)純(chun)的(de)(de)且沒有化學(xue)背景雜質(zhi)(zhi)(zhi)與之(zhi)重(zhong)疊時，才有可能(neng)測定(ding)(ding)準(zhun)確質(zhi)(zhi)(zhi)量。用單級(ji)四(si)極(ji)質(zhi)(zhi)(zhi)譜(pu)(pu)儀(yi)(yi)作(zuo)定(ding)(ding)量分析采(cai)用選擇離子監測( selected ion monito-ring, SIM)。檢測限(xian)取決(jue)于能(neng)否將(jiang)目標化合(he)物(wu)與樣品中的(de)(de)其它(ta)成分(包括(kuo)背景干擾)加以(yi)區別。雖然單級(ji)四(si)極(ji)質(zhi)(zhi)(zhi)譜(pu)(pu)儀(yi)(yi)沒有MS/MS功(gong)能(neng)，但用源內CID具有使離子誘導裂解(jie)的(de)(de)“準(zhun)MS/MS"功(gong)能(neng)。

    如(ru)果需(xu)要MS/MS功能以進(jin)行(xing)化合物結構(gou)分(fen)(fen)(fen)析(xi)或用選(xuan)擇反應監測(select-ed ion reaction monitoring, SRM)以提(ti)高選(xuan)擇性及定(ding)量(liang)分(fen)(fen)(fen)析(xi)檢測限，應采用三(san)重串聯四極(ji)質譜儀( triple quadrupole mass spectrometer, TQMS)。 在TQMS中，也是(shi)的形式是(shi)四極(ji)(MS-1) 用于(yu)前體離子選(xuan)擇，RF-only 四極(ji)作為(wei)CID區(qu)，后一級四極(ji)(MS-2) 分(fen)(fen)(fen)析(xi)產物離子。至今，用LC/ESIMS進(jin)行(xing)復雜成分(fen)(fen)(fen)的定(ding)量(liang)分(fen)(fen)(fen)析(xi)時，如(ru)藥物代謝動力學研究。

    TQMS具有(you)多種MS/MS功能(neng)，除上述產(chan)物離(li)子(zi)(zi)(zi)掃(sao)描(miao)(miao)外，還有(you)前體(ti)離(li)子(zi)(zi)(zi)掃(sao)描(miao)(miao)和(he)恒定中性(xing)丟失掃(sao)描(miao)(miao)。TQMS的(de)CID是低能(neng)過程，能(neng)量在10-100eV范(fan)圍。因為低能(neng)CID對操作(zuo)條件(jian)較敏感，故不(bu)同(tong)的(de)儀(yi)器(qi)所(suo)得(de)的(de)產(chan)物離(li)子(zi)(zi)(zi)質譜(pu)的(de).重現性(xing)較差。但(dan)是，與離(li)子(zi)(zi)(zi)質譜(pu)儀(yi)所(suo)得(de)的(de)產(chan)物離(li)子(zi)(zi)(zi)光(guang)譜(pu)比較，較少(shao)發生(sheng)重排和(he)離(li)子(zi)(zi)(zi)分子(zi)(zi)(zi)反應產(chan)生(sheng)的(de)(假象)。